原料的保存一般可以分为常温保存、冷藏保存、冷冻保存这三种。常温保存不必赘述，冷藏保存是指零度低温保存，冷冻保存则是零下低温保存。
奶精、果粉、糖浆、果浆、果汁这些原料一般都可以在常温干燥阴凉的环境之下保存，保质期可以按照包装上的说明来区分，而其他一些现煮原料，如煮好的珍珠只有三个小时到半天的保质期，则需要及时清理掉变质的原料。一些开罐开封的原料，像果粉、奶精、果汁、果浆，在使用之后要第一时间将开口扎紧或是盖上盖子，以便减少与空气的接触时间，延长保质期。
蜜豆、椰果、烧仙草、布丁等奶茶备料都需要冷藏保存，而即便是在冷藏的环境之下，这些备料的保质期一般也只有一到三天，需要分类存放，以免相互串味。
用以冷冻保存的大多都是一些生鲜小吃类的原料，冷冻环境下的保质期比较长，一般都是以月来算，不会容易过期。 奈雪の茶奶茶店都会按照严格标准来保存原料，对于过期变质的原料也会及时清理、清点，不会出现使用任何变质原料的情况。